Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL13PA6NNM8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms