Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43BA6NCK2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43BA6NCK2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms