Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00862A6NCI5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms