Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VWA3AA6NCI4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA3AA6NCI4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms