Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR11A4FU01 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR11A4FU01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR11A4FU01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms