Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTL3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTL3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GTL3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTL3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms