Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087X1B8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms