Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms