Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB3

DNAJC12, DnaJ homolog subfamily C member 12, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC12Q9UKB3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJC12Q9UKB3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJC12Q9UKB3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms