Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms