Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms