Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms