Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms