Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIN1Q9NXP7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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