Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms