Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms