Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SNX15Q9NRS6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SNX15Q9NRS6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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