Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms