Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms