Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms