Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRNP1Q96S65 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms