Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms