Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms