Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms