Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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UBXN4Q92575 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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UBXN4Q92575 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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UBXN4Q92575 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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UBXN4Q92575 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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UBXN4Q92575 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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UBXN4Q92575 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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