Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD1Q8NHV4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms