Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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