Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC141Q6ZP82 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms