Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDS2

UHRF1BP1, UHRF1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1BP1Q6BDS2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms