Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms