Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC93Q567U6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms