Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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