Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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