Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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ECM1Q16610 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ECM1Q16610 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ECM1Q16610 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ECM1Q16610 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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