Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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