Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CST6Q15828 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CST6Q15828 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CST6Q15828 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CST6Q15828 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CST6Q15828 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST6Q15828 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST6Q15828 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CST6Q15828 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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