Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms