Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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