Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms