Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms