Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms