Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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