Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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