Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FMODQ06828 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FMODQ06828 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms