Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms