Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE3AQ05086 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms