Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms