Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMF1P82094 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms