Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms