Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
BACE1P56817 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BACE1P56817 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BACE1P56817 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms